悲傷的愛德華和阿爾馮斯兩兄弟，試圖利用煉金術(shù)中最大的禁忌——人體煉成術(shù)救活撒手人寰的母親，誰(shuí)知卻遭遇巨大的災(zāi)難。失去身體的阿爾馮斯，其靈魂被封禁在鎧甲中，愛德華則以自己的右臂和左腳為代價(jià)，迫使弟弟止步冥國(guó)門前。許多年后，愛德華（山田涼介飾）成長(zhǎng)為這個(gè)國(guó)家中最年輕的鋼之煉金術(shù)師，他與弟弟（水石亞飛夢(mèng)配音）上下一心，共同奔跑在尋找賢者之石的道路上。與此同時(shí)，神秘的人造人拉絲特（松雪泰子飾）、恩維（本鄉(xiāng)奏多飾）盤桓這個(gè)國(guó)家的角落，她們策劃者恐怖的勾當(dāng)，一時(shí)間上空陰云密布……本片根據(jù)荒川弘的原作漫畫改編。