南宋年間，通古縣前任縣令為了一己私利，利用“河神”為幌子暗中擄掠兒童，百姓惶惶不安，在其蠱惑下紛紛相信用孩童祭祀“河神”可以平息災(zāi)禍。宋慈受命來(lái)到通古，向百姓一再申明祭祀河神純屬無(wú)稽之談，并保證一定會(huì)查出事情真相，他的到來(lái)使得老縣令感覺到了威脅。在老縣令的授意下，其黨羽對(duì)宋慈陽(yáng)奉陰違，并暗中施以壓迫，企圖神不知鬼不覺的將宋慈了結(jié)。在一波接一波的危險(xiǎn)降臨在宋慈身上時(shí)，孩童還在不斷失蹤，這使得老百姓對(duì)宋慈失去了信任，逼宋慈趕緊祭河神。宋慈頂著多方的壓力，抽絲剝繭地調(diào)查，利用自己高超的法醫(yī)學(xué)手段讓尸體“開口說(shuō)話”，逐漸鎖定了真兇，并發(fā)現(xiàn)了背后的巨大陰謀。最終，宋慈不惜以性命相搏將真兇繩之以法。